浩瀚的宇宙之中，一直流传着海盗王佛林特的传说。传说在他的带领下，海盗们洗劫了上千个星球的财宝，并把所有财宝收藏在神秘的星银岛。小时候的吉姆·霍金斯，很喜欢关于佛林特海盗和他的财宝的传说。
　　逐渐长大的吉姆，喜欢操纵被禁用的太阳滑板玩飞行特技。他经常被警察抓住送回家，妈妈很为他担忧。吉姆自己也很伤心，独自在酒吧外面伤神。忽然一艘飞船从天际坠落，吉姆奋力地救下船员。但船员却伤重而亡，临死前交给吉姆一个奇怪的球。
　　敌人接踵追至。妈妈苦心经营的酒吧被穷凶极恶的追兵付之一炬。吉姆把玩奇怪的球，碰巧发现了隐藏在其中的一幅星图，原来是收藏着海盗佛林特所有财宝的星银岛的地图。一听有财宝，他们的朋友迪尔伯特博士也起劲了，立刻要一起去。吉姆求妈妈同意他去寻找星银岛，他想证明给她看自己是有能力有本事的。终于，妈妈同意了，他们向港口出发，雇佣了星际飞船“遗产号”。
　　船长是猫女埃米莉亚。大副让瘦小的吉姆去给具有超凡能力的半机械人厨师西尔维打下手。西尔维身边有个可爱的小东西“变形”，它什么都能变，爱模仿别人，爱疯爱闹，可爱极了。变形喜欢吉姆，总是变换样子逗逗他。
　　终于，“遗产号”扬帆起航，离开港口。
　　在航行的日子里，吉姆给西尔维打下手。西尔维喜欢和吉姆谈心。他教了吉姆许多航行的技能，如操纵救生船、绑安全带等等。西尔维虽然严厉，经常搞得吉姆筋疲力尽，但吉姆在他的身上仿佛看见了从未谋面的父亲的影子，两人关系日渐融洽，情同父子。
　　有一天，变形捉弄吉姆，两人追闹到舱房。吉姆躲在马铃薯桶里，忽然看见厨师西尔维和船员们密谋，才知道原来厨师西尔维其实是想去星银岛找宝藏的海盗头目。
　　星银岛已经在望，西尔维升起海盗旗起事，经过一番争夺，最终还是吉姆手快先抢到了地图。他乘救生艇逃生，降落到星银岛，海盗们紧跟着追来。西尔维要求单独与吉姆谈判，答应找到宝藏后一人一半。吉姆很伤心：“你骗我，你之前对我的一切，都是在骗我！坚决不给你地图！”西尔维听后暴跳如雷，威胁吉姆说：“如果明天早上不把地图给我，就用船上的激光炮把你们给轰个稀烂！”两人不欢而散。
　　晚上，吉姆巧妙地与海盗周旋，却不料被狡猾的西尔维抢去了地图。可地图只有吉姆才能打开，西尔维只好带上吉姆一同前往。他们来到藏宝地点,吉姆将球放进地上的凹洞，这时出现一道门。当年佛林特就是用这道传送门往来于星际之间掠夺财宝的。大家进入藏宝室，却没注意碰到了脚下的红外线装置。
　　哇，宝藏！好多宝物！佛林特的尸体也在宝库里的一艘船上。正当海盗们贪婪地洗劫宝藏时，宝库内的自爆装置启动了。
　　星银岛上的大爆炸开始，宝物随着爆炸散失……危急时刻，吉姆缠住西尔维，眼看二人冲突又起，又一次爆炸声将飞船掀翻，吉姆被抛出船外。西尔维舍不得放弃财宝，用铁钩钩住了仍有部分财宝的船身。忽然“变形”跑过来告诉西尔维，吉姆身处危险之中。西尔维既不舍得放弃财宝，又想救吉姆，但终究无法两全，千钧一发之时，友情和亲情战胜了贪婪，西尔维终于放弃飞船，抓住险些坠入深渊的吉姆。两人逃出宝库，正好赶上埃米莉亚的飞船。可飞船却无法在两分钟内离开星银岛。吉姆突然想到利用佛林特的星际门来逃离，立刻动手用飞船的喷射器和铁板做了一个简易的飞行滑板，冲向星际门。终于在最后的关头打开了通往港口的星际门，大家平安回到港口。
　　劫后余生，吉姆给妈妈盖了新酒吧。由于埃米莉亚的推荐，吉姆进了皇家飞行学院。而他的老朋友海盗西尔维仿佛也在浩瀚的宇宙中默默地注视着吉姆。