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基于水稻与拟南芥全基因组序列，在基因组与蛋白质组水平上对这2种模式植物的丝氨酸羧肽酶（SCPs）基因家族进行比较分析．利用隐马可夫模型（hidden Markov models，HMM），发现水稻与拟南芥中分别存在71个与54个丝氨酸羧肽酶类（serine carboxypeptidases like，SCPL）蛋白编码基因，它们广泛分布于基因组中各条染色体上，并且存在多个基因簇聚区．基因结构分析显示，拟南芥的SCPL基因存在广泛的交替剪接方式，而这种现象在水稻SCPL基因中却不常见．蛋白结构分析表明，所