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高新技术产业创新效率的提升是创新型国家建设的重要支撑.旨在通过SBM超效率DEA模型及Sequential Malmquist指数模型对金融效率及高技术产业创新效率进行测定,并利用面板Tobit模型对金融效率及其规模效率对我国高技术产业创新效率的影响及其作用机制进行探究.研究发现:1997-2016年我国东部、 南部及北部沿海地区区域创新效率最高,西北西南地区区域创新效率次之,中部及东北部地区区域创新效率最低;西南、 东部与北部沿海地区区域金融效率最高,西北东北地区区域金融效率次之,中部及南部地区区域金融效率最低.金融效率总体上对高新技术产业创新效率具有挤出效应,但金规模融效率通过创新规模效率对金融效率起促进作用.