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兔球虫病是由艾美耳尔属的球虫引起,该属共有14个种,其中,斯氏艾美球虫可寄生于兔胆管上皮细胞内,其余各种都寄生于肠黏膜上皮细胞内,一般为混合感染。兔球虫卵囊在温度20℃,湿度55%~75%的外界环境中,经2~3d即可发育成为感染性卵囊。卵囊对化学消毒药物及低温的抵抗力很强,大多数卵囊可以越冬。但对日光和干燥很敏感,直射阳光在数小时内能杀死卵囊。