基于宏转录组研究蔬菜秸秆发酵体系细菌群落

来源 :农业环境科学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：delphizhao

【摘要】

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分析蔬菜秸秆快速好氧发酵过程中活性细菌群落丰度、组成、多样性的演变规律,为进一步挖掘微生物资源,调节发酵工艺提供理论参考依据。依托罐式有机物料快速腐解设备,选取发

【作者】

：

丁建莉魏丹金梁李艳李樵吴凯

【机构】

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北京市农林科学院植物营养与资源研究所

【出处】

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农业环境科学学报

【发表日期】

：

2020年11期

【关键词】

：

蔬菜秸秆细菌群落多样性宏转录组不同发酵时期 vegetable strawbacterial community diversitymetatranscr

【基金项目】

：

国家重点研发计划项目(2019YFD1100304),北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20190408,KJCX20200601),北京市博士后基金(ZZ2019-48),北京市农林科学院博士后基金(2019-ZZ-003),中国与联合国开发计划署合作项目(cpr/19/401)

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分析蔬菜秸秆快速好氧发酵过程中活性细菌群落丰度、组成、多样性的演变规律,为进一步挖掘微生物资源,调节发酵工艺提供理论参考依据。依托罐式有机物料快速腐解设备,选取发酵过程中4个不同发酵时期(升温期、高温期、降温期和腐熟期)的有机物料为研究对象,提取微生物总RNA、反转录cDNA,以16S rRNA基因为分子标靶,借助qPCR技术和Illumina Miseq高通量测序平台,研究不同发酵时期细菌群落丰度、组成、多样性的变化及群落组成与物料理化因子偶联分析,揭示群落与理化因子之间的相关性。不同发酵时期物料的pH

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