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自2003年共同签署《沪苏浙共同推进长三角区域创新体系建设协议书》以来,两省一市加快了科技合作的步伐,在联合开展科技攻关、实现科技资源共享、跨区域产学研合作、人才开发一体、加强知识产权协作等方面都取得了成效。但是,由于区域科技合作的体制机制尚不健全,相关配套的政策措施不完善,影响了两省一市科技合作向深层次发展。本文在分析长三角科技合作现状的基础上,提出了相应的对策建议。