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北祁连盆地群位于青藏高原北部，长期处于欧亚大陆的边缘活动带，对构造运动有着敏感的反应，各次构造运动在该区都有表现。现今北祁连盆地群经历多次构造运动的改造，先后经历了早古生代大陆裂谷阶段、晚古生代稳定陆内沉积盆地阶段、中生代的板内变形阶段和伸展断陷阶段、新生代挤压变形与前陆盆地发育阶段，是各个时期盆地叠合的产物。