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在基因识别的两类算法中，判别算法通常需要正负两类样本来训练参数．在原核生物的基因组中，由于可充当负样本的基因间序列太少，如何产生负样本便成为原核基因识别中的一个问题．本文提供了一种基于“自相似映射”的负样本生成算法，与通常使用的随机生成算法不同，该算法不需要生成随机数．本文给出了两种负样本生成算法的比较，并初步讨论了自相似性对于DNA序列分析的意义．