我国每年用于畜牧业的抗生素为6000t左右,仅沙星类药物在全国就有1000多个生产厂家,其产量的50%被掺入饲料或肥料中,用于畜牧业、水产养殖业、农业,以促进动植物生长,提高生长速度与产量。尤其是在规模化畜禽养殖生产中抗生素常作为抗菌助长剂添加到饲料中,意在控制畜禽疾病的发生,促进畜禽生长发育,提高饲养经济效益。据调查,一个年出栏1万头育肥猪的猪场,每年使用的抗生素可达2t(吨)～3t。而抗生素的长期使用,正是导致畜禽的微生态平衡失调的主要因素,这是由于:(1)抗生素会催毁畜禽肌体所拥有的正常微生物屏障,使那些原来被正常菌群屏障所抑制的内源性病原菌或外源性病原菌得以大量生长繁殖,造成畜禽正常微生物群微生态平衡的破坏。(2)促进耐药性菌株的增加。由于畜禽肌体长期应用抗生素,在消灭敏感菌株的同时,可以通过突变和选择等机制促进正常微生物群对抗生素耐药性的增加,制造出任何抗生素都无法消灭的"超级细菌"。郭云昌等(2005)从我国8省市市售鸡肉中分离到的51株沙门氏菌进行耐药性检测及多重耐药谱分析,其结果表明,所分离的51株沙门氏菌均为多重耐药株,至少对3种以上的抗生素耐药,特别是51株沙门氏菌对万古霉素、红霉素、苯唑西林均具有耐药性,提示我国畜牧养殖业在使用抗生素方面存在严重问题。同时,在畜禽饲料、饮水中长期加入抗生素,不仅使消化道的耐药性细菌逐渐增加,甚至大部分肠道菌都可能获得耐药性,严重破坏微生态平衡,而且还可能引发严重的流行病,甚至发生公共卫生问题。专家强调指出,微生态平衡是指正常微生物群与其宿主(人类、动物或植物)的相互制约、相互依赖的,动态的生理性相对均衡和稳定的组合状态。微生态平衡是微生态学的核心内容,是从微生物与宿主统一体的观点出发,探讨微生物之间、微生物与宿主、微生物和宿主与外环境的生态平衡问题。畜禽微生态平衡直接关系到畜禽的健康,正确认识微生态平衡、了解、寻找微生态平衡失调的原因,采取科学破解微生态平衡失调的防治措施,才能建立和重新恢复微生态平衡,以保障畜禽的健康养殖。在养殖业中提倡和运用微生态平衡的新理念、新方法和新技术在畜禽规模养殖生产中应用,来促进畜禽的健康养殖和提高畜禽产品的质量,已成为我国畜禽规模化养殖的发展趋势和紧迫课题。