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采用PCIK技术获得细鳞鲑秦岭亚种25尾个体的线粒体DNA控制区598bp的序列，从GeneBank下载黑龙江流域的尖吻细鳞鲑与钝吻细鳞鲑的同源序列，以近缘物种哲罗鲑为外类群，构建了中国细鳞鲑属的分子系统发育树，并结合形态特征讨论了细鳞鲑秦岭亚种的有效性。遗传结构分析显示，秦岭亚种与黑龙江流域两种细鳞鲑之间以及后两种细鳞鲑之间的遗传距离分别为：0．0202，0．0207，0．0199，明显大于细鳞鲑属种内遗传距离：0．0023，0．0033，0．0091。以邻接法（NJ）和最大简约法（MP）构建的系统发育