基于KEGG通路和基因互作网络对充血性心力衰竭相关基因的筛选

来源 :中国现代应用药学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hq520cyj
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目的 筛选与充血性心力衰竭(congestive heart failure,CHF)相关的药物靶点基因,利用DAVID通路数据库和基因互作网络分析目标基因的分布和功能,促进CHF的研究和新药的开发.方法 以“congestive heart failure”检索NCBI基因数据库,提取CHF相关基因数据,采用DAVID分析工具提取基因富集的通路数据.对40个非冗余基因所显著富集的11条KEGG通路进行了分析,同时对富集通路中的基因同HPRD人类蛋白互作网络进行匹配,建立通路中关键基因的互作网络.并对所建立的相关子网进行比较,筛选和CHF相关的药物靶点基因.结果 MMP9、LMNA、DMD、EMD、AGTR1、EDNRB、NOS3和TNF等21个CHF相关基因需要完善研究,LMNA、MMP9和AR 3个基因可能是CHF治疗药物间接作用的重要靶点.结论 CHF发病与cGMP-PKG信号通路、钙离子信号通路、扩张型心肌病、肥厚型心肌病等多个通路相关.MMP9、LMNA、DMD、EMD、AGTR1、EDNRB、NOS3和TNF等21个CHF相关基因在病理和治疗中都占有重要的地位.通过分析疾病相关基因的代谢通路和互作网络,有助于了解疾病的分子基础,并为新药研发提供可借鉴的思路.
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