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黄连素是黄连、黄柏、三棵针中提取的具有生物活性的小檗碱（Ber）和人工合成的Ber。多年来临床上常用治疗肠道细菌感染疾病。近年用于治疗眼结膜炎、化脓性中耳炎、胃溃疡、高血压、心率失常、防治肿瘤、肝癌、结肠癌、肺癌、白血病、食管癌、脑部肿瘤和膀胱癌等，以及放疗增敏作用，高血脂、充血性心力衰竭、抗血小板聚集、肠易激综合征、皮肤病、抗皮肤移植排斥反应。