上饶早梨‘六月雪’和‘黄皮消’全基因组重测序分析

来源 :浙江农林大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：skybabay

【摘要】

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以上饶早梨Pyrus pyrifolia 2个品种‘六月雪’‘Liuyuexue’和‘黄皮消’‘Huangpixiao’试管苗为材料,进行全基因组重测序分析。结果表明:2个样本的总单核苷酸多态位点(SNP

【作者】

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洪森荣曾清华谭鑫陈永华郑亚娇徐迎昕邱梦琴

【机构】

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上饶师范学院生命科学学院

【出处】

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浙江农林大学学报

【发表日期】

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2019年2期

【关键词】

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园艺学上饶早梨 '六月雪’ '黄皮消’ 全基因组重测序分析 horticulture early pear(Pyrus pyrifolia)i

【基金项目】

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2014年度江西省高等学校科技落地计划项目(KJLD14086).

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以上饶早梨Pyrus pyrifolia 2个品种‘六月雪’‘Liuyuexue’和‘黄皮消’‘Huangpixiao’试管苗为材料,进行全基因组重测序分析。结果表明:2个样本的总单核苷酸多态位点(SNP)数量分别为6 171 357和6 140 603个,编码区内无义突变位点(nsSNP)分别为335 659和332 280个。对nsSNP的常见变异(common variant, CV)分析发现,共有2 282个nsSNP关联了2 067个基因。2个样本的总插入缺失位点(INDEL)分别为800 38

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