桑树TrnL-trnF基因间隔区序列的特点及分析

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设计桑树TrnL-trnF基因间隔区序列的特异引物,扩增并分析了桑属育71-1和桑莲2个品种的TrnL-trnF基因间隔区序列,其长度分别为414 bp和417 bp,且富含A/T.该序列有421个分析性状,具有17个变异位点.在这些变异中主要以碱基的插入和缺失(主要是插入/缺失dA)为进化形式,其余的发生了少数置换.除这些变异位点以外的核苷酸序列完全相同,说明两者有高度同源性,与桑科、菊科和蔷薇科的TrnL-trnF基因间隔区序列有一定同源性.用Clustalx软件对21份材料的TrnL-trnF基因间隔区序列进行聚类分析,建立了系统进化发育树.
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