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本文简要综述了国内外近两年微卫星标记（SSR）和单核苷酸多态标记（SNP）在动物育种研究包括遗传多样性、品种鉴定及血缘分析、遗传图谱构建、标记辅助选择中的应用进展，以期为我国畜禽分子育种的深入发展提供借鉴。其中遗传多样性的研究主要是利用SSR，我国对各种畜禽大部分品种群体遗传结构的研究已经趋于完成，这有利于更好的保护和利用我国固有的品种资源。国际上已经对猪、牛构建了标记密度较大的遗传图谱，在这些标记中，SSR占了绝大多数，其中鸭和马的遗传图谱构建在最近取得了较大进展。目前畜禽的QTL定位使用的标记主要为S