在分析全国农业生态系统脆弱性影响因素的基础上,以农业生态敏感性、农业生态恢复力和农业生态干扰性为准则,构建9个一级指标和16个二级指标的农业生态系统脆弱性评价指标体系,综合相关统计年鉴、气象、遥感等数据,利用主成分分析法赋权评价农业生态系统脆弱区的空间分布和各农业可持续发展区的生态脆弱性程度。结果表明,主要分布在我国东部和中部农业生态系统微度和轻度脆弱区面积占51.97%,主要分布在西部地区的中度、重度和极度脆弱区面积占48.03%。全国农业可持续发展区的优化发展区中农业生态系统微度和轻度脆弱区占93.92%,适度发展区中轻度和中度脆弱区占79.93%,保护发展区中重度和极度脆弱区占85.27%,总体来说农业生态系统的脆弱程度排序为保护发展区>适度发展区>优化发展区,二级分区排序为青藏区>西北及长城沿线区>黄淮海区>西南区>长江中下游区>华南区>东北区。研究结果对于根据农业生态系统的脆弱程度选择不同的发展策略,保护农业生态环境,促进全国农业可持续发展具有重要的实践意义。