【摘 要】
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对于可观察到的分子序列进化模型的不同,提出一个相对简单的方法--卡方检测,来检测在DNA序列间替代过程的同质性.这个卡方检测方法不管在座位间下列3个条件是否满足皆是成立
【机 构】
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哈尔滨工业大学生命科学与工程系,西南农业大学基础科学与技术学院,西南农业大学农业与生命科学学院,哈尔滨工业大学生命科学与工程系
【基金项目】
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国家高技术研究发展计划(863计划)，国家自然科学基金
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对于可观察到的分子序列进化模型的不同,提出一个相对简单的方法--卡方检测,来检测在DNA序列间替代过程的同质性.这个卡方检测方法不管在座位间下列3个条件是否满足皆是成立的:(1)替代率的异质性;(2)进化率/模型的相关性;(3)替代模型的变异.计算机模拟也显示出卡方检测在各种生物学条件下的序列进化模型是非常有效的.在真实数据中,11种节肢动物线粒体DNA的比较中发现,水蚤或卤虫与其他9种节肢动物以高百分比违背了同质性进化模型假设,显然是由于AT含量高而引起的,且在两种蚊子的线粒体DNA比较中发现,其满足同
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