肾透明细胞癌关键候选基因和通路的生物信息学分析

来源 :现代泌尿外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：fengdl0040

【摘要】

：

目的运用生物信息学方法筛选及鉴定肾透明细胞癌(ccRCC)相关的潜在靶基因及信号通路。方法在GEO网站搜索基因芯片GSE40435、GSE53757、GSE46699和GSE16441的数据集,用GEO2R识

【作者】

：

肖菲祝恒成

【机构】

：

武汉大学人民医院东院泌尿外科

【出处】

：

现代泌尿外科杂志

【发表日期】

：

2020年12期

【关键词】

：

肾透明细胞癌生物信息学分析差异表达基因蛋白互作网络核心基因 clear cell renal cell carcinomabioinformatical

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目的运用生物信息学方法筛选及鉴定肾透明细胞癌(ccRCC)相关的潜在靶基因及信号通路。方法在GEO网站搜索基因芯片GSE40435、GSE53757、GSE46699和GSE16441的数据集,用GEO2R识别ccRCC和正常肾组织之间的差异表达基因,并对4组数据的共同差异表达基因进行聚类分析。然后用DAVID网站对差异基因进行基因本体(gene ontology)分析和KEGG通路富集分析,最后用STRING网站和Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,同时从中筛选出最具有意义的模块及核

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