头颈鳞癌预后相关差异表达LncRNAs的筛选、ceRNA网络构建及生物学功能预测

来源 :山东医药 | 被引量 : 0次 | 上传用户：asijhvherjknvn

【摘要】

：

目的利用生物信息学方法筛选头颈鳞癌(HNSCC)预后相关的差异长链非编码RNA(LncRNAs),构建预后相关LncRNAs的ceRNA网络,并分析其生物学功能。方法以P<0.05和|log2FC|>1.0为标

【作者】

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吴丽芷申丽君黄茂凌祁承林杨蕊盛建飞陈始明

【机构】

：

武汉大学人民医院

【出处】

：

山东医药

【发表日期】

：

2021年3期

【关键词】

：

长链非编码RNA HOXA11-AS 竞争性内源性RNA网络头颈鳞癌 long non-coding RNA HOXA11-AS competing endo

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(81770981),湖北省卫健委科研项目(WJ2019M186,WJ2019M195)

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目的利用生物信息学方法筛选头颈鳞癌(HNSCC)预后相关的差异长链非编码RNA(LncRNAs),构建预后相关LncRNAs的ceRNA网络,并分析其生物学功能。方法以P<0.05和|log2FC|>1.0为标准,通过TCGA数据库筛选HNSCC组织与对照组织中差异表达的LncRNAs,并用Kaplan-Meier Plotter生存分析法对组织中不同lncRNA表达水平的HBSCC患者的生存率进行比较,挑选出有诊断潜力且未被报道的lncRNA作为候选lncRNA。利用star⁃Base在线网

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