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目的调查上海市90所二级及以上医院患者临床病原学送检及耐药菌检出现状,为促进临床病原学标本正确送检、降低耐药菌提供数据支持。方法采用网络填报的形式,于2015年1月1日-2015年12月31日对上海市90所二级及以上医院2015年患者抗菌药物使用、病原学送检及耐药菌的检出进行回顾性调查,数据采用SPSS 20.0统计软件进行分析。结果上海市90所二级以上出院患者抗菌药物平均使用率为52.97%,二级医院抗菌药物平均使用率为51.0%,高于三级医院45.1%(χ~2=7247.429,P<0.001);病原体送检中痰培养标本平均送检占比P50(P25,P75)为25.14%(16.74%,37.82%)高于血培养送检占比8.53%(5.93%,12.96%);多药耐药菌检出以产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌(ESBL-ESC)检出率最高为50.65%,其次为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)49.19%;痰标本中以检出耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌(CRAB)和耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(CRPA)为主,分别占79.85%和79.39%;MRSA在痰标本中病原体中的构成比(5.38%)高于血标本(2.91%),差异有统计学意义(P<0.001);MRSA、CRAB与CRPA在痰标本病原体中分别占5.38%、7.20%、4.45%,均高于血标本2.91%、0.82%、0.37%(P<0.001)。结论需加强正确的临床病原学标本送检,重视无菌部位病原学送检率,针对性地对二级医院抗菌药物使用加大规范与管理,延缓多药耐药菌的产生。