【摘 要】
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目的 挖掘隐藏在头颈部鳞癌中抑癌基因TP53表达异常的机制。方法 从TCGA数据库中选取279例头颈部鳞癌样本的测序数据,利用cbioportal获得TP53基因在头颈部鳞癌中的表达情况及
【基金项目】
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内蒙古医科大学科技百万工程项目(KJbw2013014)
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目的 挖掘隐藏在头颈部鳞癌中抑癌基因TP53表达异常的机制。方法 从TCGA数据库中选取279例头颈部鳞癌样本的测序数据,利用cbioportal获得TP53基因在头颈部鳞癌中的表达情况及其对患者生存的影响,并筛选样本中与TP53存在共表达关系的基因。利用String和DAVID数据库,建立TP53的共表达网络并分析网络功能,通过lncRNA2target和Star Base数据库,筛选出能够调控TP53的短链非编码RNA(microRNA),长链非编码RNA(lncRNA)和竞争性内源性RNA(ceRN
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