为探究上海黄浦江枯水期和丰水期浮游动物群落结构及其对环境的指示作用,于2013年11月和2014年7月分别对黄浦江11个断面（82个采样点）进行了调查分析。共鉴定出浮游动物109种,其中原生动物35种（占总种类数的32%）,轮虫33种（30%）,枝角类18种（17%）,桡足类23种（21%）。浮游动物丰度变化范围为1 671.8⁷0 428.4 ind.·L^-1,生物量变化范围为0.26¹4.97 mg·L^-1。丰水期浮游动物的丰度及生物量约为枯水期的2倍。聚类分析显示,枯水期与丰水期各个站点的浮游动物群落结构相似性不一致,枯水期可分为5个类群,丰水期为3个类群。相关性分析表明,原生动物密度与氨氮呈显著负相关;轮虫密度与总磷呈显著正相关,与叶绿素呈极显著正相关;枝角类密度与叶绿素呈极显著正相关,与氨氮呈显著正相关;桡足类密度与叶绿素和水温均呈极显著正相关。由此表明,黄浦江浮游动物的群落结构与水温、叶绿素以及水体的营养状况关系密切。淡水麻铃虫（Leprotintinnus fluviatile）、淡水筒壳虫（Tintinnidium fluviatile）、广布多肢轮虫（Polyarthra vulgaris）、脆弱象鼻溞（Bosmina fatalis）、微型裸腹溞（Moina micrura）、桡足幼体（Copepodid）、无节幼体（Nauplii）、台湾温剑水蚤（Thermocyclops taihokuensis）和球状许水蚤（Schmackeria forbesi）等9个种的存在与否以及是否成为水体的优势种可以作为评定黄浦江等河流水体富营养化水平高低及污染程度轻重的指示物种。该研究可为后期对黄浦江的生态监测及水域生态修复提供理论基础,同时可为未来黄浦江水环境质量、水生态现状及其演变趋势的评价提供参考依据。