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目的探讨无痛内镜术在胃肠道疾病诊治中的应用效果。方法选择我院2014年3月—2016年3月收治的胃肠道疾病患者80例为研究对象，应用抽签的方法将80例患者划分为观察组和对照组。对照组患者应用常规胃镜诊治，观察组患者应用无痛内镜术诊治，对比2组患者的临床表现。结果2组患者诊断结果完全一致，无误诊、漏诊，差异无统计学意义（P>0.05）；在治疗耐受性方面，观察组患者耐受性为100.0%，对照组患者耐受性为50.0%，差异有统计学意义（P<0.05）。结论无痛内镜术可为胃肠道疾病诊治中提供确切的依据