环境保护的监督管理体制是环境管理的关键,比较中日环境保护监督管理体制有助于深化对我国的认识并得出改进意见。中日两国环保监管机构的产生背景和发展脉络各不相同,但进入21世纪后都有了稳固的趋势。日本中央环保监管机构设置相较科学、工作任务向全球环境治理转变,而我国中央机构设置相对冗杂,工作任务着重于国内污染防治。日本地方公共团体对环境保护承担整体性责任,我国环境法也有相关规定,但在实践中落实存在问题。中央与地方的环保监管权限划分也应是监管体制的内容之一,日本中央和地方关系呈现出平等合作、中央不断还权于地方的趋势,而我国中央和地方关系则体现出权力逐渐集中的趋势。对比之下,我国在机构设置上应更注重协调性与综合性、权限分配上应更注重地方政府的主体性与能动性、配套制度建设上应强化政府整体责任、完善民主参与制度等。