Ssc-miR-133a-5p的靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析

来源 :猪业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lyl_chong
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课题组前期通过高通量测序技术发现,microRNAssc-miR-133a-5p在肥胖猪脂肪组织中表达水平显著下调,推测其可能在脂肪沉积过程中发挥了重要作用.分析ssc-miR-133a-5p序列保守性,利用TargetScan,miRDB和miRWalk在线分析工具预测其候选靶基因,进一步对候选靶基因进行蛋白质互作分析以及KEGG分析,最后将预测的靶基因与课题组前期筛选出的与猪脂肪沉积能力相关的基因取交集.结果表明ssc-miR-133a-5p候选靶基因PPARGC1A与RORA等,参与AMPK,TNF,与胰岛素分泌等信号通路.结果提示ssc-miR-133a-5p的候选靶基因可能通过多种信号通路发挥重要作用.文章的结果可为microRNA参与猪的脂肪生成调节机制提供科学依据.
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