[目的]通过观察针灸通督、常规针刺、药物三种疗法对缺血性脑卒中患者细胞凋亡相关指标Caspase-3(半胱天冬氨酸蛋白酶-3)、Caspase-9(半胱天冬氨酸蛋白酶-9)水平的影响和临床疗效的差异,探讨针灸通督疗法治疗缺血性脑卒中的作用机制。[方法]将120例缺血性脑卒中患者随机分为针灸通督组(A组)、常规针刺组(B组)、药物对照组(C组),各组患者在治疗前后均进行Caspase-3、Caspase-9、神经功能缺损、ADL(日常生活活动能力)检测,并将其结果进行对比分析。[结果]三种疗法均有不同程度的降低Caspase-3、Caspase-9活性、改善神经功能缺损及ADL的作用,有显著性差异(P<0.05),且针灸通督组各观察指标改善明显,与常规针刺组、药物对照组相比,有显著或非常显著性差异(P<0.05或P<0.01)。[结论]针灸通督疗法具有抑制细胞凋亡、促进患者神经功能恢复和改善患者日常生活活动能力的作用,其作用机制可能与减少患者脑神经元凋亡相关蛋白Caspase-3、Caspase-9的表达有关。