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目的了解新疆地区新生儿苯丙酮尿症(PKU)及先天性甲状腺功能低下症(CH)的发病率及新生儿疾病筛查的情况,探讨提高筛查率的干预措施。方法对新疆地区53家提供生育医疗服务机构2010~2013年度新生儿筛查资料进行回顾性分析。结果PKU的发病率是1:7833,CH的发病率是1:1566,明显高于全国水平。结论通过新生儿疾病筛查可早期发现、早期诊治PKU、CH患儿,可有效降低患儿残疾发生率,提高出生人口素质。