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本研究对来自合作藏猪（合作群体、玛曲群体、碌曲群体）共386头（份）的线粒体D环（mt DNAD-loop）高变区核苷酸进行了分析。结果表明,在长度为435 bp的核苷酸序列中共检测到23个多态位点,占所测核苷酸的5.287%,其中有2个单一多态位点和21个简约信息位点,合作猪单倍型多样度（Hd）为0.873、核苷酸多样度（Pi）为0.00549、平均数核苷酸差异（k）为2.338。合作群体单倍型多样度和核苷酸多样度最高（0.883、0.00549）、碌曲群体最低（0.839和0.00348）。合作群体对