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孙氏论命门动气认为:命门为两肾动气,属坎中之阳;命门动气为生生不息之根。论三焦相火认为:三焦外有络而内无形;三焦为相火,乃原气之别使。同时还提出君火、相火有裨助生生不息之功。这些学术观点既阐发了《难经》之旨,又能自出机杼,并与临床辩证论治相结合。其学术理论和实践经验对祖国医学作出了重要贡献。