新型冠状病毒肺炎（简称新冠肺炎）病位主要在肺，涉及脾、胃、心包，病机特点包括湿、毒、热、寒、瘀、闭、虚。虽为新发疫病，其病变过程仍遵循温病辨证体系之卫气营血辨证、三焦辨证、湿热三焦辨证所涵盖的疾病发展规律。疫邪上受，首先犯肺，肺卫失宣，此为卫分阶段，属上焦肺之病变，治宜清宣肺气，疏泄达邪；若初起邪阻膜原，又宜疏利化浊，透达膜原。上焦肺卫之邪不解，进一步发展，出现疫邪阻肺、肺气郁闭、湿阻脾胃等证，此时邪入气分，治宜宣肺燥湿，辟秽化浊，根据病性寒热不同，或清热平喘，或温化祛湿，兼燥者润燥肃肺；若疫邪上受，由肺直趋中道，发病即见明显肺与脾胃证候，属于卫气同病，为上、中焦之病变，治宜芳香化浊，宣畅气机，开肺建中。若气分之邪不解，深入营分、传入上焦心包者，可清营养阴、透热转气、清心开窍。疫邪炽盛，正气虚馁，疫毒闭阻于内，或初起疫邪由肺逆传心包，出现内闭外脱证候，治宜清心开窍、生津救逆、回阳固脱等。部分患者初期或病变过程的某一阶段表现出寒湿性质，但随着疾病演变，多呈现出“湿热疫”或“温热疫”病变特点，仍可用温病辨证体系指导辨治。