近海水体环境DNA沉降对沉积物中纤毛虫分子多样性评估的影响

来源 :海洋与湖沼 | 被引量 : 0次 | 上传用户：weishuange0l

【摘要】

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在陆架海区沉积物中,DNA高通量测序技术可检获大量浮游寡毛类和舞毛类等非底栖纤毛虫,这些源于水体的环境DNA(eDNA)如何影响对沉积物中纤毛虫分子多样性的评估,以及影响程度

【作者】

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黄平平赵峰徐奎栋

【机构】

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中国科学院海洋研究所,中国科学院大学

【出处】

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海洋与湖沼

【发表日期】

：

2020年3期

【关键词】

：

纤毛虫海洋水体海洋沉积物分子多样性 DNA高通量测序 cDNA高通量测序 ciliate sea water marine sediment molecu

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目,41876171号,41476144号

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在陆架海区沉积物中,DNA高通量测序技术可检获大量浮游寡毛类和舞毛类等非底栖纤毛虫,这些源于水体的环境DNA(eDNA)如何影响对沉积物中纤毛虫分子多样性的评估,以及影响程度如何尚不明确。本研究选取了黄海冷水团中的两个站位,通过提取水体和沉积物中DNA和RNA,并采用直接提取法和洗脱法提取沉积物DNA,结合DNA和cDNA测序技术,探讨了水体和沉积物中纤毛虫分子多样性的关系。研究表明,基于洗脱DNA法、直接提取DNA法和cDNA法获得的沉积物中纤毛虫OTUs数分别为451、312和324个,其中211个O

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