【摘 要】
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研究以太湖区域中林地、桃园、稻田以及链接这些典型土地的河流共8个点为取样地,借助16S r RNA扩增子高通量测序和分析技术,基于Illumina Hi Seq测序平台,利用双末端测序的方
【机 构】
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江苏省农业科学院农业资源与环境研究所,农业部长江中下游平原农业环境重点实验室,省部共建国家重点实验室培育基地-江苏省食品质量安全重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(41571458);国家自然科学青年基金项目(31600419)
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研究以太湖区域中林地、桃园、稻田以及链接这些典型土地的河流共8个点为取样地,借助16S r RNA扩增子高通量测序和分析技术,基于Illumina Hi Seq测序平台,利用双末端测序的方法得到1 865 862条原始序列,通过对原始序列进行拼接、过滤,得到1 712 497条有效序列,按照97%相似性将优质序列划分为95 132条可操作分类单元(OTU,operational taxonomic units),同时基于OTUs信息计算Alpha和Beta群落丰富度和多样性指数,并采用RDP Classi
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