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生物性污染主要有细菌、霉菌、病毒、寄生虫、昆虫等。被细菌或其毒素污染的食物，从表面上看无明显异常改变，但食人人体后会在几十分钟或几个小时内发生食物中毒；有毒霉菌如青霉菌、黄曲霉菌等，产生的毒素污染食品后，可以引起急性或慢性中毒，甚至诱发癌症。如黄曲霉菌产生的黄曲霉毒素，与人类肝癌的发生有着密切的关系。能导致人体疾病的寄生虫有许多种，如绦虫、旋毛虫、蛔虫、姜片虫等。当人们进食被其幼虫或虫卵污染的食物而感染，就可发生相应的寄生虫病。