基于分子对接技术从虾夷扇贝中筛选抗SARS-CoV-2活性肽研究

来源 :食品科学技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：KAI12321

【摘要】

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为从食品原料中筛选具有抗2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)能力的生物活性肽段,选用虾夷扇贝肌球蛋白为目标序列,利用计算机对虾夷扇贝肌球蛋白进行模拟酶解,对酶解所得的肽段

【作者】

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步营何玮王飞朱文慧李学鹏仪淑敏徐永霞励建荣

【机构】

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渤海大学食品科学与工程学院/生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心/国家鱼糜及鱼糜制品加工技术研发分中心,大连工业大学海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心

【出处】

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食品科学技术学报

【发表日期】

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2020年4期

【关键词】

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分子模拟模拟酶解 SARS-CoV-2 虚拟筛选分子对接抗新型冠状病毒肽段 molecular simulationsimulated enzymatic

【基金项目】

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“十三五”国家重点研发计划项目(2018YFD0400603),辽宁兴辽英才项目(XLYC1807133)

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为从食品原料中筛选具有抗2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)能力的生物活性肽段,选用虾夷扇贝肌球蛋白为目标序列,利用计算机对虾夷扇贝肌球蛋白进行模拟酶解,对酶解所得的肽段进行毒性和生物活性预测。选取活性评分超过0.5且无毒性的肽段,以SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白和COVID-19 Mpro水解酶为靶标进行分子对接,鉴定其病毒抗性。结果表明:肽段CSNAIPEL可以与SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白上的GLN42和GLU329两个关键氨基酸结合,LibDock Score为136.0

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