致病疟原虫分子功能注释二级数据库的构建

来源 :中国生物医学工程学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：aurogon1

【摘要】

：

为对疟原虫致病分子机制研究过程中产生的高通量实验数据快速高效地进行功能注释,构建致病疟原虫分子功能注释二级数据库。本数据库基于J2EE技术、MySQL和MVC三层体系架构,利

【作者】

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许三岗庄永龙郝志勇单广良杨啸林王恒

【机构】

：

中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院

【出处】

：

中国生物医学工程学报

【发表日期】

：

2012年6期

【关键词】

：

疟原虫功能注释二级数据库 plasmodium molecular functional annotation secondary database

【基金项目】

：

科技部国家科技基础条件平台科学数据共享工程重大项目基础医学科学数据中心（2005DKA32402）

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为对疟原虫致病分子机制研究过程中产生的高通量实验数据快速高效地进行功能注释,构建致病疟原虫分子功能注释二级数据库。本数据库基于J2EE技术、MySQL和MVC三层体系架构,利用Web Services和Hibernate等技术实现其主要框架,通过调用Fisher＇s精确检验R程序包对Gene Ontology和Pathway的注释结果进行富集效应分析,并调用Graphviz工具对蛋白质相互作用结果进行图形化描述。致病疟原虫分子功能注释二级数据库提供多入口的分子注释类型,使Gene Ontology、Pat

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