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探针设计是SARS病毒再测序DNA微阵列制作的关键步骤，为了保证探针的杂交条件尽可能一致，采用了作者提出的两种等长变覆盖的探针设计方法，即基于Tm距离的算法和遗传算法。针对SAILS病毒基因组中的两段特异序列设计了一组探针，并与等长移位法和变长变覆盖法的设计结果进行了比较。等长变覆盖法得到的探针集在探针长度一致的情况下，探针的Tm值有较小的标准差和变化范围。结果表明，等长变覆盖法得到的探针具有更好的杂交条件一致性。