在全球碳中和与我国“双碳”目标框架下，中药资源产业必须确立高质量发展的新理念，改变以往企业同质化竞争和产业整体粗放式发展模式。本文以实现中药资源产业碳中和为目标，以环境价值和健康价值创造为路径，以中药资源绿色产业价值链组合模式创新为方法，实现中药资源产业各个环节的资源要素整合及企业低碳价值创造和健康价值创造活动的流程重构，创新中国特色的绿色产业价值链。研究发现：首先，由于环境污染具有外部性，存在市场失灵问题，在双碳目标下重塑中药资源绿色产业价值链需要以国家低碳政策推进产业绿色化发展；其次，企业组织职能转型与调整，需要以行业组织制定绿色产业发展的标准体系，对企业健康产品价值和低碳价值综合测评能力评估为抓手，推进中药资源产业高质量发展；最后，产业中的龙头企业必须进行供应链管理创新，引领和影响上下游企业间进行绿色价值链和健康价值链融合，最终实现中药资源绿色产业价值链组合模式创新。