【摘 要】
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从NCBI中下载阔叶猕猴桃全基因组数据,从中筛选出叶绿体基因组数据后,完成叶绿体基因组拼接组装,并对其进行叶绿体基因组SSR分析、聚类分析及密码子偏好性分析。注释结果显示
【基金项目】
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贵州省落叶果树特色种质资源收集保存和创新利用(黔农科院自主创新科研专项字[2014]08号),猕猴桃品种资源的引进、收集和评价(黔农科院院专项[2013]014号),猕猴桃溃疡病抗性材料筛选及抗病性评价指标初步研究(黔科合LH字[2014]7710号),贵州山地特色果树资源评价与应用创新平台(黔科中引地[2018]4002),火龙果耐低温种质收集及相关生理机制研究(黔科合平台人才[2017]560
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从NCBI中下载阔叶猕猴桃全基因组数据,从中筛选出叶绿体基因组数据后,完成叶绿体基因组拼接组装,并对其进行叶绿体基因组SSR分析、聚类分析及密码子偏好性分析。注释结果显示,阔叶猕猴桃叶绿体基因组全长155 964 bp,平均GC含量37.30%,SSC、 LSC和IR区长度分别为20 496 bp、88 564 bp和23 452 bp;注释得到117种功能基因,其中包括83种蛋白质编码基因,4种核糖体rRNA基因和30种tRNA基因。SSR分析结果共发现36个SSR位点,其中单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸
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