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2007年6月卫生部在给国务院“关于疾病预防控制体系建设工作进展情况的报告”中谈到，“党中央、国务院提出的疾病预防控制体系三年建设目标已经基本实现。同时，也存在需要不断加强和改善的问题，主要是：财政保障机制不健全，缺乏稳定长效的投入机制”。这一问题的提出，既说明了此问题存在的广泛性和严重性，又表明了卫生部乃至国务院对此问题的高度重视。