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详细分析了地铁馈线短路电流中存在的谐波成分对电流上升率保护的影响,在此基础上,利用地铁馈线短路时暂态电流中的直流部分可近似表示为指数形式的特点和交流分量做一周积分时为零的原理,提出了一种采样数据处理算法来消除谐波影响.通过利用Labwindows/CVI仿真,证明该算法能使短路波形得到平滑,且引起的误差很小.