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水下导航信息融合专家系统知识库的核心是知识库与推理机，包括书本及导航专家经验。导航知识通过知识获取机构存入知识库，由知识管理工具维护。通过抽取水下导航中各传感器获得的信息特征，并标准化后得到数据库数据。在模型方法库中存储数据计算的方法。在控制系统的管理协调下，推理机运用知识库中的知识，综合数据库的数据和条件，调用模型方法库中的模型和方法进行推理，获得适用的导航信息。