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[目的]建立一套适合番茄幼苗根系蛋白质组分析的SDS—PAGE方法和获得清晰的电泳图谱。[方法]以番茄幼苗根系为试材，对根系蛋白的提取方法和上样量等因素进行了优化。[结果]上样量为60斗g时，改良后的TCA一丙酮沉淀法提取的蛋白能够获得分辨率较高、图像清晰、重复性好的SDS-PAGE图谱。[结论]该法可以基本满足番茄幼苗根系蛋白质组学的研究。