【摘 要】
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目的:测定和分析我国登革2型病毒福建株(FJ-11)基因组非编码区(NCR)序列,为探讨其结构特征与功能的关系提供依据.方法:从登革2型病毒感染的C6/36细胞中提取总RNA,采用RACE法
【机 构】
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军事医学科学院微生物学流行病学研究所
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目的:测定和分析我国登革2型病毒福建株(FJ-11)基因组非编码区(NCR)序列,为探讨其结构特征与功能的关系提供依据.方法:从登革2型病毒感染的C6/36细胞中提取总RNA,采用RACE法扩增病毒基因组5′和3′端片段,分别将其克隆至pGEM-T载体,挑取阳性克隆进行序列测定;利用RNAdraw软件对非编码区二级结构进行预测.结果与结论:我国登革2型病毒FJ-11株基因组5′和3′非编码区长度分别为96?nt和454?nt,具有黄病毒共有的保守序列和二级结构.与登革2型病毒美洲基因型比较显示,5′NCR第69位核苷酸的改变对其二级结构有影响;3′NCR端约70?nt能形成相同的保守结构,而前380?nt呈现多处核苷酸的差异而导致两者预测的二级结构差别较大,它们可能对病毒基因组RNA的复制起重要作用.
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