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目的：探讨分析医院药剂科在抗菌药物合理应用中的作用。方法：采用随机数字表法将320例使用抗菌药物的患者分为对照组和实验组，每组160例，其中对照组患者进行常规抗菌药物使用，实验组患者进行医院药剂科干预抗菌药物使用的措施，观察并比较两组患者抗菌药物使用情况。结果：医院药剂科干预抗菌药物使用后，实验组患者住院费用、住院时间、使用抗菌药物种类和给药天数均明显少于对照组患者；实验组患者更换抗菌药物发生率（12．50％）和联合用药发生率（10．00％）均明显低于对照组患者更换药物发生率（37．50％）和联合用药发生率（36．25％），差异具有统计学意义（P ＜0．05）。结论：医院药剂科干预抗菌药物使用后，更换抗菌药品和联合用药的发生率明显降低，患者平均住院费用、住院时间、使用药物种类和给药天数均明显缩小，保障了用药者的利益，应该在临床上广泛应用。