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蛋白质分子多尺度模型的比较研究
蛋白质分子多尺度模型的比较研究
来源 :江苏理工学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ufs6756dude
【摘 要】
:
多尺度模型是分析蛋白质结构-功能关系的有效方法。采用分子动力学和粗粒化模型从不同尺度分别计算了Pin1肽脯氨酰顺反异构酶的残基波动性,运动交叉相关和低频运动模式。两种
【作 者】
:
常珊
史航
【机 构】
:
江苏理工学院电气信息工程学院,江苏理工学院计算机工程学院
【出 处】
:
江苏理工学院学报
【发表日期】
:
2015年6期
【关键词】
:
分子动力学
粗粒化模型
构象变化
molecular dynamics
coarse grained model
conformational change
【基金项目】
:
国家自然科学基金(31200990), 江苏省品牌专业建设项目(PPZY2015B133), 江苏理工学院重点学科建设项目
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多尺度模型是分析蛋白质结构-功能关系的有效方法。采用分子动力学和粗粒化模型从不同尺度分别计算了Pin1肽脯氨酰顺反异构酶的残基波动性,运动交叉相关和低频运动模式。两种模型均能较好描述实验结构附近的运动特征,而分子动力学方法更准确地模拟了突变后引起的构象变化。
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