宫颈癌相关基因HLA-DRB1编码区SNPs的生物信息学分析

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目的用生物信息学的方法建立筛选宫颈癌相关基因HLA—DRB1编码区SNPs的技术平台,筛选出与宫颈癌发病相关联的SNPs。方法使用SNPper软件从公共数据库dbSNP获得HLA—DRB1编码区的SNPs数据,在dbSNP数据库获取相应的FASTA序列,使用PARSESNP软件进行分析。结果在HLA—DRB1基因的编码区发现2个SNPs(rs1059576和rs1059582),其单核苷酸的变化会引发错义突变,PSSM Difference大于10,该突变为有害突变。另外rs9269958变异则引发终止密
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