【摘 要】
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【背景】枝孢菌SYC63是一株具重寄生作用、抗菌活性的潜在生防菌株，目前还无研究报道该菌株的全基因组序列，因此限制了对其的开发与利用。对该菌株进行基因组测序与分析，将进一步了解其重寄生的分子机制，为其在生物防治上的应用奠定研究基础。【目的】解析枝孢菌SYC63基因组序列信息，初步探究该菌的重寄生作用机制。【方法】利用二代高通量测序平台对枝孢菌SYC63进行全基因组测序，使用相关软件对其测序数据进行
【基金项目】
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云南省农业基础研究联合专项面上项目（2017FG001[-043]）； 中央引领地方科技发展专项资金（219001）； 云南省教育厅科学研究基金（2021Y270）；
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【背景】枝孢菌SYC63是一株具重寄生作用、抗菌活性的潜在生防菌株，目前还无研究报道该菌株的全基因组序列，因此限制了对其的开发与利用。对该菌株进行基因组测序与分析，将进一步了解其重寄生的分子机制，为其在生物防治上的应用奠定研究基础。【目的】解析枝孢菌SYC63基因组序列信息，初步探究该菌的重寄生作用机制。【方法】利用二代高通量测序平台对枝孢菌SYC63进行全基因组测序，使用相关软件对其测序数据进行基因组组装、基因功能注释、预测次级代谢产物合成基因簇并分析重寄生相关的碳水化合物酶类基因等。【结果】基因组组装后共得到17个Contigs，总长度为31 912 211 bp，GC含量为52.80%，预测到12 327个编码基因。其中，4 029、949、6 595个基因分别能在KEGG、COG和GO数据库中被注释到，同时，还预测到25个次级代谢产物合成基因簇。对重寄生机制相关的碳水化合物酶类进行分析并与重寄生菌株（拟盘多毛孢菌、木霉及盾壳霉）比较，发现该菌具有较多的糖苷水解酶和糖脂酶基因，并且细胞壁降解酶类基因经锈菌孢子壁处理后在转录组测序中显著上调表达，初步分析了该菌与重寄生木霉在分子水平上的差异及不同于木霉真菌的寄生机制。【结论】从基因组层面解析了枝孢菌的重寄生机制，为深入探究其寄生机制及次生代谢产物的挖掘提供参考信息，对后续开发与利用具有重要意义。
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