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文章利用新疆1990-2018年14个地州市的农业数据,采用Malmquist指数法动态测算了农业生产效率,运用面板门槛回归模型对新疆农业劳动力流动对农业生产效率的影响机制进行实证检验.研究表明:新疆农业劳动力在城乡间从单向零星流动到规模流动转变的城镇化率临界区间为37.2%~46.9%;从单向规模流动到双向流动转变的区间为57.5%~67.6%.新疆农业劳动力流动对全要素生产率、纯技术效率和技术进步效率具有促进作用,但对规模效率具有抑制性.可以根据新疆各地州市农业劳动力流动转变情况,实施差异化的农业发展政策和土地流转方式.