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针对柔性作业车间调度问题自身的特点，提出一种将化学反应算法和禁忌搜索相结合的混合算法。该混合算法使用精英保留策略将较优个体保留到子代中，并采用基于工序和基于机器的编码方法。为提高化学反应，优化算法的全局搜索能力，设计了4种基本操作来保证种群的多样性。同时混合算法中引入禁忌搜索，使混合算法具有较好的局部搜索能力。最后，进行了算法性能对比试验，结果验证了该混合算法的有效性。