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为了提高高性能集群计算系统的容错能力，检查点设置成为一种广泛采用的手段．目前检查点设置多采用的协调式设置协议，该协议在集群规模扩展情况下，同步操作造成巨大的系统时间开销，并阻塞正常计算的执行．针对该问题，使用非协调式检查点设置协议消除同步操作，采用消息日志记录方式保证系统状态一致性，并利用线程后台执行方式达到透明性设置．最后，通过典型的系统实验，验证了该方法的有效性，并进行同协调式协议设置的时间开销对比．